距今50多年前，一艘来自赛博坦的飞船坠落月球，由此引发了美苏两国的太空竞赛。人类争相登上月球，只为一探飞船残骸中的秘密。时间回到21世纪初，经过几番征战，汽车人终于挫败霸天虎的入侵，继而与人类合作，共同保卫美丽的地球。然而发生在切尔诺贝利的事件却将尘封已久的月球计划重新摆到桌面。为了防止霸天虎找到能

在美国路易斯安那州的巴吞鲁日市，一研究生化武器实验室不幸将一病毒泄露出去，造成该市大批平民被感染成僵尸。而事发时，副总统正在该市进行竞选演讲，因此海军一海豹突击队奉命去营救副总统。因该市一中情局实验室的科学家能成功阻止此次病毒蔓延，故海豹突击队在将副总统送上直升机后，又被赋予新的任务，去营救那名女专

当年那场惨烈的芝加哥大战，汽车人虽然成功击退了霸天虎的入侵，却也让地球人对他们失去了应有的信任与尊重。由美国中情局组建的“墓风”部队对所有的变形金刚进行无差别的猎杀，一时间汽车人和霸天虎全都在地球不见了踪影。某天，居住在得州的落魄机械发明家凯德·伊格（马克·沃尔伯格 Marky Mark 饰）买回来